狗狗睡醒咳嗽可能有多种原因，如：

1. 呼吸系统问题：狗狗可能患有类似支气管炎、气管瘤等呼吸系统疾病，睡醒后咳嗽是因为呼吸道被刺激。

2. 心血管问题：狗狗可能患有心血管疾病，睡醒后因为血液循环问题导致咳嗽。

3. 过敏：狗狗可能对某些物质过敏，睡醒后咳嗽是因为呼吸道被刺激。

4. 消化问题：狗狗可能患有胃肠疾病，睡醒后咳嗽是因为胃酸反流引起的。

5. 环境问题：狗狗可能生活在空气污染较严重的环境中，睡醒后咳嗽是因为吸入污染空气导致的。如果狗狗经常睡醒咳嗽，建议及时带它去兽医检查。