三个月的小狗吃自己大便，首先要考虑是不是饮食方面的问题。如果小狗没有吃饱，或者食物中的营养不均衡，可能会导致它吃大便来获取更多营养。可以适当增加小狗的喂食量，并选择营养丰富、易于消化的狗粮。其次，小狗可能是因为缺乏微量元素而出现这种行为，可以给它补充一些宠物专用的微量元素片。

另外，要及时清理小狗的粪便，不让它有机会接触到。当发现小狗吃大便时，要立刻用严厉的声音制止它，或者用一些小的惩罚措施，如轻轻拍打它的鼻子，但不要过于严厉，以免伤害到小狗。同时，要多陪伴小狗，给它提供足够的玩具和关注，分散它的注意力。