乌龟腐甲病的治疗方法如下：

改善水质：腐甲病往往由水质不好、水中细菌滋生所引起，健康的乌龟长时间待在这样的水中，也可能会患上腐甲病。因此，需要更换水质，保持水的新鲜和清洁。

隔离与消毒：将患病的乌龟隔离起来，以防止传染给其它乌龟。同时，可以给腐烂的地方涂抹药物进行治疗。轻度腐甲，可以用双氧水先清洗消毒，然后涂抹红霉素眼膏或云南白药，每天用药一次，1~2周为一个疗程。对于中度或重度腐甲，已经散发出腐臭味，需要将死甲剥离出去，再用双氧水或高锰酸钾消毒，并用凡士林封口，还要口服一点土霉素或注射抗生素进行治疗。如果病情很严重的话，需要给它注射抗生素进行治疗，一般7~10天为一个疗程。

干养：将乌龟干养一段时间，期间每天让它泡水2~3次即可。在病龟泡水之后，及时擦干病龟的身体，然后用双氧水清洗消毒病龟的患处，消毒完成后再给它涂抹上药膏。保持一定的温度，直到乌龟痊愈为止。