猫嗜酸性肉芽肿的诊断需结合临床症状、细胞学检查、组织病理学检查，同时排除其他类似疾病，属于综合性诊断过程。首先观察临床症状，该病常见于年轻猫咪，好发部位包括口腔黏膜（如唇缘、牙龈）、皮肤（如面部、四肢、腹部），典型病变为单个或多个隆起的结节或斑块，颜色多为粉红色、红色或灰白色，质地较硬，口腔内病变可能伴随流涎、口臭、进食困难，皮肤病变可能出现脱毛、溃疡、瘙痒。

其次进行细胞学检查，通过细针穿刺病变组织，涂片后染色镜检，若观察到大量嗜酸性粒细胞，可初步怀疑该病；最终确诊需依靠组织病理学检查，手术切除部分病变组织进行病理切片，在显微镜下观察到特征性的嗜酸性粒细胞浸润、肉芽肿结构，同时排除细菌感染、真菌感染、肿瘤（如淋巴瘤）等其他可能引起类似病变的疾病。