猫咪杯状病毒没有特效杀灭药物，治疗以对症用药为主。口服宠物专用广谱抗生素，预防继发细菌感染；猫咪出现口腔溃疡时，搭配口腔喷雾减轻溃疡疼痛；打喷嚏、流鼻涕期间服用抗病毒制剂，搭配赖氨酸增强抵抗力。全部药剂严格依据猫咪体重控制用量，遵从兽医给出的疗程服用。

患病期间加强日常养护是恢复关键，喂食适口性好的流质罐头补充营养。保持环境温暖干燥，远离冷风刺激；单独隔离患病猫咪，杯状病毒传染性较强，做好环境消杀。治疗周期坚持7‑14天，用药不要中途停止。痊愈之后病毒会短期存在一段时间，定期复查，减少复发的可能性。