猫咪眼睛感染存在复发的可能性，但是做好规范治疗和养护，能够有效降低复发概率。如果初次治疗用药疗程不足，表面症状消失就停药，病原体没有被彻底清除，潜伏在眼部，环境变化、猫咪免疫力下降时感染就会再次发作。衣原体、支原体这类病原体本身就容易潜伏，复发概率相对更高。

环境和猫咪自身状态也是关键诱因。环境灰尘多、猫砂粉尘大，持续刺激眼黏膜；猫咪长期应激、营养不良，免疫力低下，会更容易再次感染。每次痊愈之后，保持环境清洁，减少刺激性物品，保证猫咪充足营养。定期观察眼部状态，一旦发现少量分泌物、流泪，尽早干预，避免感染再次加重。