食蚊鱼通常30-40天繁殖一次。食蚊鱼属于卵胎生，雄鱼的臀鳍前部是它的交配器，繁殖的时候会追逐雌鱼进行交配，一般卵在体内受精和孵化。

食蚊鱼的繁殖能力比较强，而且产仔量大，雌鱼一般每次可以产仔30-50尾，每年能产仔200-300尾，而且产仔后的2-7天，当它的卵子再次成熟之后，就可以再次交配怀孕生产。另外，食蚊鱼的繁殖季节为4-10月，适宜的季节为5-9月，在白天与晚上，食蚊鱼均可以交配，不过多在白天时交配，当水温上升至20℃以上时，雌鱼就会开始产仔，不过在12月水温下降后，食蚊鱼便会停止繁殖。