马头犬瘟多肽的主要作用是辅助治疗犬瘟热病毒感染，增强患犬的抗病毒能力和免疫力。它含有多肽类成分，能帮助抑制病毒复制，减轻病毒对机体的损害，缓解犬瘟热引起的发热、咳嗽、呼吸道症状及消化道不适。

同时，它可调节患犬的免疫功能，提升机体对病毒的抵抗力，为后续恢复提供支持。该药物通常作为犬瘟热综合治疗的一部分，需配合抗病毒药物、对症治疗及营养支持，单独使用效果有限。使用时需在兽医指导下，根据病情轻重确定使用时机和剂量。