蝙蝠不属于鸟类，而是哺乳动物。从生理结构看，蝙蝠有毛发，而鸟类是羽毛；蝙蝠有典型的哺乳动物口腔结构，鸟类是鸟喙。
繁殖方式上，蝙蝠是胎生，幼崽在母体内发育成熟后出生，靠母体乳腺分泌的乳汁哺育；鸟类是卵生，通过产卵孵化繁殖。呼吸方式也不同，蝙蝠用肺呼吸，鸟类除肺部呼吸外，还有气囊系统辅助呼吸。这些差异表明蝙蝠在进化历程中与哺乳动物更为接近，而不是鸟类。
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