蝙蝠是由原始真兽类动物演化而来，并非由老鼠进化。蝙蝠属于哺乳纲翼手目，其祖先可追溯至约1.6亿年前的原始真兽类动物，例如化石证据中发现的中华侏罗兽。这类动物体型微小（约10厘米长），以昆虫为食，擅长攀爬树木，是真兽下纲（包括人类、啮齿类等）的共同远祖。
已知最早的蝙蝠化石是5000万年前的食指伊神蝠，具有回声定位能力。蝙蝠通过前肢特化为翼膜实现飞行，这一特征独立演化，与鸟类或翼龙无关。
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荐读: 翼手目(Chiroptera)是哺乳动物纲的第二大目，其种类和数量仅次于啮齿目，也是除人类外分布最为广泛的物种，俗称这个种群为蝙蝠，是惟一真正会飞翔的哺乳动物类群。
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