蝙蝠是多种病毒的自然宿主，其携带的病毒种类多达数百种，包括冠状病毒、狂犬病毒、亨德拉病毒、尼帕病毒等。这些病毒能在蝙蝠体内长期共存而不引发严重病症，可能与蝙蝠独特的免疫系统有关 —— 其体温调节能力强（飞行时体温可达 40℃），可抑制病毒复制；免疫反应适度，避免过度炎症损伤机体。

蝙蝠传播病毒的主要途径包括排泄物（粪便、尿液）、唾液或直接叮咬，人类通过接触污染环境或食用未煮熟的蝙蝠制品可能感染。例如，2003 年的 SARS 病毒、2019 年的新冠病毒均被推测与蝙蝠有关，而狂犬病毒在蝙蝠中的携带率也较高。