穿山甲的洞穴通常为盲洞，即没有分支或出口直接通向外界，这样的结构有助于穿山甲隐藏和防御天敌。穿山甲会选择土层松软、相对湿润、有机质丰富的土壤（如黄壤土）中挖掘洞穴。洞穴往往位于较陡的斜坡上，洞口通常与天空形成一定的夹角，有助于预防雨水灌入。

此外，根据季节的不同，穿山甲会挖掘不同类型的洞穴。冬洞通常筑于背风向阳、地势较低的地方，结构复杂且深达数米，内部铺有细软杂草以保暖和育婴；夏洞则相对较浅，筑在通风凉爽、地势较高的山坡上，其洞穴具有30°至60°的坡度，坡向多偏南，以便在冬季保持一定温度。