主要是大熊猫生育能力低下。雌性大熊猫每年只有2-3天可以交配，而且很难受孕。即使怀孕了，也很容易流产或者死胎。而且，大熊猫的幼崽非常弱小，出生时只有150克左右，相当于妈妈体重的千分之一。在自然环境中，这样的幼崽很难存活下来。

还有一个就是食物问题。大熊猫能够从距今约800万年前活到今天，靠的主要是食性的转变，因为主要以竹子为食的大型动物很少，所以竹林是一个相对空白的生态位，这里缺少食肉动物，食草动物也很少，几乎是没有天敌和竞争的。但是，大熊猫主要以竹子为食的食性也成为了一个问题，那就是过度依赖于竹子，一旦竹子出现了问题，它就会面临食物短缺的问题。