消灭果蝇需采取综合措施，结合物理、化学与生物方法。物理方法中，粘虫板、电蚊拍等工具可直接捕捉成虫，尤其适用于小范围侵扰。化学方法则需谨慎使用，可选用低毒性的拟除虫菊酯类喷雾，但需避免直接接触食物或宠物，且需注意通风。生物防治方面，某些微生物制剂（如苏云金芽孢杆菌）可特异性感染果蝇幼虫，阻断其发育。

此外，环境调控同样重要：保持室内干燥通风，降低湿度至50%以下；果蔬冷藏储存，减少暴露时间；定期清洁冰箱密封条、排水口等隐蔽区域。长期预防需建立卫生习惯，如每日清理垃圾桶、定期检查储存食物，从根本上消除果蝇的生存基础。