处理果蝇需从环境清洁与物理诱捕两方面入手。首先，需彻底清理厨房、垃圾桶等易滋生果蝇的区域，及时丢弃腐烂果蔬，密封厨余垃圾，避免果汁残留。果蝇偏好潮湿环境，因此需定期清理水槽、排水管道中的有机物堆积，减少其繁殖场所。其次，可利用果蝇对发酵物质的趋性进行诱捕。

例如，将苹果醋、红酒或糖水与少量洗洁精混合后倒入容器，用保鲜膜覆盖并戳孔，果蝇进入后会被洗洁精破坏表面张力而溺亡。此外，市售的果蝇诱捕器或紫外线灯也可有效减少成虫数量。对于顽固性侵扰，可结合生物防治手段，如引入果蝇天敌（如某些寄生蜂），但需注意生态平衡。