蝴蝶兰花是有根茎的，它的根为气生根，根冠敏感，栽培需注意保护。茎短而压扁，支撑叶片和花序，输送养分。蝴蝶兰为附生性兰花，在园艺上属于气生兰类。这种叫法就是以其根的生长习性而命名，即只有暴露于空气中的气生根而无伸入地里生长的地生根。

此外，蝴蝶兰的气根多为圆柱形或扁圆形，肉质。它的外表呈白色者为根被，有保护根内组织、吸附固定以及吸收空气中水分和养分的作用。而茎一般很短，多是压扁状，它是蝴蝶兰的支柱，起到支撑叶片和花序以及输送水分和养分的作用。所以要注意，家里有狗狗的，避免让狗狗咬到茎部。