鲸鱼没有鱼鳃。鲸鱼虽然在形态上与鱼类相似，但它们属于哺乳动物，与鱼类有根本的区别。具体来说，鲸鱼的前肢演化为鳍，但仍保留有肩胛骨和肱骨等四肢骨骼的结构，后肢则完全退化。鲸鱼没有鳃裂，而是有鼻孔，位于头顶，俗称喷气孔。

鲸鱼的肺与哺乳动物相似，由肺泡和气管组成，有两个肺，类似于陆地上的哺乳动物。它们通过浮出水面或通过在水下浮泳时迅速升至水面来呼吸，呼吸过程涉及将空气吸入肺部，然后通过呼气将二氧化碳释放到环境中。这种呼吸机制是典型的哺乳动物特征，与鱼类的鳃呼吸系统有很大的不同。