处方粮和普通粮的主要区别在于它们的针对性和功能。

针对性：处方粮是根据动物具体的病情、营养状况所搭配的，具有一定辅助治疗作用的膳食。例如，针对患有肥胖症的宠物，处方粮会降低日粮中脂肪含量，增加蛋白质及纤维素含量，使宠物降低能量摄入，达到减肥的目的。而普通粮则是满足生长需求的营养，又能达到饱感的普通日用粮。

功能：处方粮是针对患病宠物的不同症状，用来代替日常宠粮，辅助宠物康复或者帮助宠物更好的提高免疫力、补充营养的宠物粮。而普通粮则仅满足宠物的生长需求和饱腹感。

因此，处方粮和普通粮的区别在于其针对性和功能上，处方粮更具有辅助治疗作用，能更好的帮助宠物康复或提高免疫力。