1、两者的趾的数量不同：偶蹄动物蹄甲数为偶数一般为四或二；奇蹄动物前后脚通常只有3个趾起作用，在进步的马类中甚至只有1个趾。

2、两者的胃室数量不同：奇蹄动物胃室少；偶蹄动物部分成员胃室多。

3、两者的盲肠构造不同：偶蹄动物的盲肠一般短而小；奇蹄动物盲肠大而呈囊状可协助消化植物纤维。

偶蹄动物前后脚的趾数都是偶数--两个或四个，而且，脚的中轴通过第三趾和第四趾之间，身体重量也就放在第三趾和第四趾上。

奇蹄动物脚的中轴通过中趾，第一趾（大拇指）和第五趾一般都已消失，这样，前后脚通常只有3个趾起作用，在进步的马类中甚至只有1个趾。