主要用于治疗猪和鸡的革兰氏阳性菌感染，比如猪痢疾、鸡坏死性肠炎等，也可以用于猪和鸡支原体感染。

兽用盐酸林可霉素为白色或者类白色粉末，按林可霉素计算，猪每日40-70mg/L（每1升水兑40-70mg）混饮，连续使用7天；鸡150mg/L（每1升水兑150mg）混饮，连续使用5-10天即可。盐酸林可霉素对厌氧菌、革兰氏阳性需氧球菌，弓形虫等有广谱抗菌作用。真正药用的盐酸林可霉素为盐酸一水合物，这是盐酸林可霉素有效的原料关键。盐酸林可霉素可溶性粉的水溶液，正常情况下的pH值应该是酸性的效果才好。