麝香龟认主人。虽然麝香龟的智商并不是很高，不能认清主人的长相，但是它可以通过熟悉主人的气味和声音，产生条件反射的行为。所以麝香龟养的时间久了，是能认识主人的。当麝香龟认识主人之后，会在主人喂食的时候将头伸出来，主动爬到主人边上，主人抚摸的时候，也基本上也不会反抗，还会表现出很享受的样子。

如果主人给麝香龟喂食的时候，发现它会四肢很快划水，主动接近自己，然后张开嘴巴，等待着自己投食，这也表示麝香龟认可主人了。麝香龟也会分辨主人和陌生人，一旦家里来了陌生人，麝香龟会把头缩进去，变成一个缩头麝香龟。而家里只有主人时，麝香龟不会拘束，它会充满好奇心地到处探索。