黄毛鼠性格比较胆小，黄毛鼠是以植物性食物为主的杂食性鼠类。水稻、甘薯、甘蔗、小麦、玉米、花生、豆类瓜菜等，无一不食，但比较喜欢吃营养价值较高的种子食物，有时也食少量的动物性食物，而且它的食性往往随着作物的变更而改变。

黄毛鼠对自然环境的适应性很强，因而栖息地的类型十分广泛，但以作物区为主，是作物区的主要鼠种。黄毛鼠广泛栖息在稻田、甘蔗地、甘薯地、香蕉地、菜园，其中以稻田区为多。此外，堤岸、灌丛、茅草坡也有其活动和栖居。黄毛鼠一般不入人房，只是在紧靠农田的房舍内才偶有发现。