萌萌宠驱虫药通过干扰寄生虫生理机能实现驱杀效果。体外驱虫产品的核心成分伊维菌素，能与寄生虫神经肌肉细胞的GABA受体结合，阻断神经信号传递，导致寄生虫麻痹死亡，对跳蚤、蜱虫、螨虫等体外寄生虫有高效触杀作用。

体内驱虫药如吡喹酮片，可破坏绦虫的皮层结构，使其失去附着于宿主肠道的能力，最终随粪便排出体外，从而清除肠道内寄生虫。

部分萌萌宠驱虫药采用复方配方，比如伊维菌素与阿苯达唑组合，能同时覆盖体内外寄生虫感染，实现广谱驱虫。这些成分在推荐剂量下对宠物安全，且经皮肤吸收后可在宠物体内形成持久保护屏障，降低再次感染风险。