清除果蝇，可以将粘板或黏蝇纸放置在厨房、垃圾桶附近、水果盘周围等果蝇经常出没的地方。粘板和黏蝇纸表面有黏性物质，果蝇一旦落在上面就会被黏住，无法逃脱。也可以将紫外线灯放置在厨房等果蝇容易聚集的场所。果蝇对紫外线较为敏感，不喜欢在有紫外线照射的环境中活动，紫外线灯可以起到驱赶作用。

果实蝇的天敌包括寄生蜂、蜘蛛、鸟类等。其中，寄生蜂是果实蝇幼虫的重要天敌，它们能在果实蝇幼虫体内产卵，从而控制其数量。果农可以通过购买并释放适量的寄生蜂，建立天敌种群，达到长期控制果实蝇的效果。