河蚌的身体结构主要包括外套膜、斧足、肌肉等。外套膜紧挨着壳的内面包围蚌体，有辅助呼吸的作用。斧足用于扭蚌的运动，位于内脏团的腹侧，也是食用的主要部分。肌肉包括前闭壳肌与后闭壳肌，呈柱状，可使扭蚌紧紧闭合双壳，或是通过开闭蚌壳让食物随水流进入外套腔进行摄食。

此外，河蚌内脏团包括胃、消化腺、肠道、心脏等，这些器官串联在一起，形成内脏团，负责河蚌的消化和循环等生理功能。河蚌的鳃位于外套腔内，是河蚌的呼吸器官，同时也帮助河蚌进行摄食。鳃上分布着鳃丝，通过纤毛的摆动过滤水中的食物颗粒。