兽用黄芪多糖和头孢噻呋钠可以合用，但不应混合使用或稀释。兽用黄芪多糖具有益气固本、调节机体免疫力、促进抗体形成、抗病毒等作用。头孢噻呋钠对多杀性巴氏杆菌、溶血性巴氏杆菌、胸膜肺炎放线杆菌、沙门氏菌、大肠埃希菌、链球菌、葡萄球菌等有较强的杀灭作用。

当动物出现病毒性疾病时，可以将头孢噻呋钠和兽用黄芪多糖合用，同时另一侧注射高免血清，两者结合使用可以起到更好的治疗效果。但是，混合使用可能会引起药物的相互作用，增加副作用的风险。兽用头孢噻呋钠的常见副作用包括肠胃道问题、过敏反应等，而兽用黄芪多糖一般无明显的副作用。具体的副作用还需根据动物的个体差异和使用情况来综合评估。