金边黑山龟头中等大小，棕色或黑色，顶部无鳞，吻短，缘呈“^”形；颈部背面黑色，腹面淡黄色。背甲椭圆形，颜色变异较大，棕红色、黑色或棕黑色；具3条纵棱，崎棱为黄色；背甲前缘平切，后缘不呈锯齿状,腹甲椭圆形，发育良好，整体棕黑色或黑色，或有黄色镶边，就好像在黑色的腹甲中镶了金边一样，故俗称“金边黑山龟”。腹甲肛盾后缘缺刻。四肢灰色、棕黑色或黑色，前肢前部具大鳞片，前肢与后肢的指、趾间具发达的蹼。尾短，灰色或黑色。