果蝇是双翅目果蝇科小型昆虫，其形态特征高度适应快速繁殖与生存需求。体长仅1.5-4毫米，体色以黄褐色为主，部分种类呈黑色。头部显著特征为一对鲜红色复眼，复眼内侧分布三对眼缘刚毛，中央形成单眼三角区，下方生有一对单眼刚毛。触角第三节呈椭圆形或圆形，触角芒羽状分枝，着生于复眼间前下方。雄性果蝇前足跗节特化出性梳——成排鬃毛结构，用于交配识别。

胸部背面可见两对透明膜质翅，前翅脉纹清晰，后翅退化为平衡棒。腹部细长，雌性腹部末端延伸为产卵器，雄性则形成交配器官。其发育过程经历完全变态：卵长0.5毫米，白色香蕉形；幼虫为无足蛆状体，分三龄，终龄幼虫体长4-5毫米；蛹为围蛹，表面具呼吸角突；成虫羽化后12小时内即可交配，雌蝇单次产卵量达300-400粒。