消灭水果蝇可以采取以下多种方法。首先是环境治理，及时清理熟透或腐烂的水果、蔬菜，以及发酵类食品，它们是吸引果蝇的源头，要密封好并尽快处理。同时保持室内清洁，定期清扫厨房、垃圾桶周边等区域，减少食物残渣和异味。

利用果蝇的趋性进行诱捕，可自制诱捕器，将苹果醋、果汁等与少量洗洁精混合，放入容器中，果蝇会被气味吸引，接触液体后会被洗洁精黏住而死。也可以使用黏性苍蝇拍或自制黏性纸板来直接捕杀果蝇。还可以通过温度调控来减缓其繁殖速度，因为果蝇在 25℃下繁殖很快，适当调低室内温度能起到一定作用。另外，晒干的柑橘皮或柏木的香气也能驱赶果蝇，起到辅助作用。