灭果蝇需结合物理诱捕与化学防治，针对其喜食发酵物的习性，可自制环保型诱捕装置。例如，将苹果醋或红酒倒入透明容器，加入少量洗洁精（降低液体表面张力），用保鲜膜封口并戳小孔，果蝇进入后会被黏液困住。此外，市售的果蝇专用粘虫纸利用黄色胶板吸引并黏附果蝇，适合放置在垃圾桶、果盘附近。

若需快速杀灭，可使用含拟除虫菊酯成分的喷雾剂，但需避免直接喷洒在食物表面，且需在通风环境下使用。长期防治需配合环境清洁，定期清理厨房残渣、丢弃腐烂水果，并保持排水管畅通，防止果蝇在潮湿处产卵。