液相色谱是分析河豚毒素的常用方法之一。高效液相色谱具有分离效率高、分辨率好及速度快等特点。在分析河豚毒素时，通常先将样品用适当的溶剂提取，如用 0.1% 乙酸提取水产品中的河豚毒素，再经过 C18 固相萃取柱净化。

以庚烷磺酸钠为离子对试剂，应用反相离子对液相色谱分离河豚毒素，采用在线柱后衍生系统，荧光检测器定量检测。该方法可使河豚毒素在一定浓度范围内呈良好的线性相关，具有较高的回收率和较低的相对标准偏差，能够准确地对河豚毒素进行定量分析。