小熊猫主要分布在喜马拉雅山脉周边的亚洲东南部地区，其栖息地横跨多个国家，核心分布区域包括尼泊尔、不丹、印度东北部、缅甸北部以及中国的西南山区。在中国，小熊猫主要见于西藏东南部、云南西北部和四川西部的高海拔森林中，如四川的凉山、甘孜等地，这些区域多为海拔2000-4800米的山地混交林或针叶林，气候凉爽湿润，植被茂密，适合其树栖生活。

它们对栖息地的选择较为苛刻，偏好有竹林和树洞的环境，因为竹子是其主要食物来源之一，而树洞和岩石缝隙则可作为休息和躲避天敌的场所。在垂直分布上，小熊猫会随着季节变化迁移，夏季可能前往更高海拔的凉爽区域，冬季则下移至海拔较低处觅食。

由于栖息地碎片化和人类活动的影响，小熊猫的分布范围正逐渐缩小，目前已被列入《世界自然保护联盟濒危物种红色名录》（IUCN）的“濒危”等级，保护其栖息地（如中国的自然保护区）成为维持种群数量的关键措施。