河豚的毒素主要分布在卵巢、肝脏、肾脏、眼睛、血液、皮肤等部位。其中，卵巢和肝脏的毒素含量通常最高，是最危险的部位。

河豚卵巢在繁殖季节毒素含量会显著增加，此时的卵巢毒性极强。肝脏也是毒素集中的器官，即使是少量摄入含有肝脏毒素的河豚组织，也可能导致中毒。肾脏、眼睛和血液中也含有一定量的毒素，而皮肤中的毒素含量相对较少，但也不可忽视。

值得注意的是，不同种类的河豚鱼，其毒素分布和含量可能会有所不同。而且，河豚毒素性质稳定，一般的烹饪方法很难将其完全破坏，所以在处理和食用河豚时必须格外小心，确保去除有毒部位，以避免中毒事故的发生。