水蛭在养殖过程中易受环境、饲料及病原微生物影响，常见疾病包括干枯病、白斑病、肠胃炎、吸盘出血及腹部结块。干枯病多因高温、低湿环境引发，病蛭表现为食欲不振、活动减少、身体干瘪、失水萎缩，最终全身发黑死亡。预防措施包括搭建遮阳棚、保持池水湿度在70%以上，并在饲料中添加维生素C增强抗病力。

白斑病由原生物多子小瓜虫感染引起，病蛭体表出现白色泡状物或斑块，运动失衡，厌食。治疗时可用0.3%食盐溶液浸泡病蛭10分钟，每日2次，连续3天，同时清理池底残饵，保持水质清洁。肠胃炎多因食用变质饲料引发，病蛭表现为腹部隐痛、腹胀、腹泻，粪便呈水样或带黏液。