秋刀鱼在日本有多种受欢迎的吃法。盐烤是日本人最爱的烹饪方式之一，将秋刀鱼撒上少许盐烤制，然后搭配味噌汤、萝卜咸菜、酱油一同食用。在烤制过程中，秋刀鱼的油脂渗出，使得鱼肉更加鲜嫩多汁，盐的咸味与鱼肉的鲜美相互融合，味道十分美妙。

除了盐烤，蒲烧也是常见的做法，将秋刀鱼刷上特制的酱汁进行烤制，酱汁的香甜与鱼肉的鲜嫩相得益彰。此外，秋刀鱼还可以做成干煎和寿司、刺身（生鱼片）等。在日本的秋刀鱼定食用套餐中，除了萝卜泥，秋刀鱼常常搭配柑橘或柠檬、腌渍小菜，再加上味增汤和清甜的米饭，即使还有一丝苦味，也是内脏的苦涩混合上温暖的脂肪，苦中带咸，再喝上一口温热的酒，别有一番风味。